Material Details

Genomic Spectra of Biliary Tract Cancer

الطيف الجينومي لسرطان السبيل الصفراوي

24th February, 2017
1445
Views

العربية

 

Download
(52 times downloaded)

Description:

Video produced by Research Square: https://www.researchsquare.com/

Article Abstract
The incidence of biliary tract cancer (BTC), including intrahepatic (ICC) and extrahepatic (ECC) cholangiocarcinoma and gallbladder cancer, has increased globally; however, no effective targeted molecular therapies have been approved at the present time. Here we molecularly characterized 260 BTCs and uncovered spectra of genomic alterations that included new potential therapeutic targets. Gradient spectra of mutational signatures with a higher burden of the APOBEC-associated mutation signature were observed in gallbladder cancer and ECC. Thirty-two significantly altered genes, including ELF3, were identified, and nearly 40% of cases harbored targetable genetic alterations. Gene fusions involving FGFR2 and PRKACA or PRKACB preferentially occurred in ICC and ECC, respectively, and the subtype-associated prevalence of actionable growth factor-mediated signals was noteworthy. The subgroup with the poorest prognosis had significant enrichment of hypermutated tumors and a characteristic elevation in the expression of immune checkpoint molecules. Accordingly, immune-modulating therapies might also be potentially promising options for these patients.

تزايد عالمياً حدوث سرطان السبيل الصفراوي biliary tract cancer (BTC)، بما فيه سرطانة الأقنية الصفراوية داخل الكبدية (ICC) وخارج الكبدية  (ECC) وسرطان المرارة. ومع ذلك لم تتم الموافقة على أي من العلاجات الجزيئية المستهدفة إلى وقتنا الحالي. قمنا هنا بتوصيف 260 BTCs كما قمنا بالكشف عن طيف من التبدلات الجينومية التي تضم أهدافاً علاجية جديدة. تمت ملاحظة طيف متدرج من البصمات الطافرة مع كثافة أكبر في بصمات الطفرات المرافقة للـ APOBEC في سرطان المرارة والـ ECC. تم تعريف اثنتين وثلاثين جينةً متبدلة بشكل واضح، بما فيها ELF3، وقد حوت قرابة 40% من الحالات تبدلات جينية قابلة للاستهداف. معظم التبدلات في ICC and ECC كانت اندماجات جينية متضمنة FGFR2 and PRKACA or PRKACB ، وكان انتشارتحت النوع المرافق للإشارات المتواسطة بعامل النمو القادر على الفعل actionable growth factor أمراً جديراً بالملاحظة. لوحظ أن  تحت النوع المرافق لأسوأ إنذار كان غنياً بالأورام كثيرة الطفرات، كما لوحظ ارتفاع مميز في التعبير عن جزيئات نقاط التفتيش المناعية. تبعاً لذلك، فقد تكون العلاجات المعدلة للمناعة خيارات واعدة أيضاً لهؤلاء المرضى.


CancerCancer TherapyGastroenterologyGeneticsGenome & Genomics



Research Square


2015


Article Citation: Nakamura H., Arai Y., Totoki Y., Shirota T., Elzawahry A., Kato M., Hama N., Hosoda F., Urushidate T., Ohashi S., Hiraoka N., Ojima H., Shimada K., Okusaka T., Kosuge T., Miyagawa S. and Shibata T. Genomic Spectra of Biliary Tract Cancer. Nat Genet. (2015);47(9):1003-10.

Share: